Bem vindo.
Lembro-me de ver a solução para o teu problema aqui no fórum.
Se não me engano essa água entra pela borracha que está a vedar a passagem dos fios do habitáculo do motor para o interior do carro.
Borracha essa cuja função é precisamente a de não deixar entrar a água, mas com o tempo fica ressequida.
Solução:
Passar um pouco de silicone nessa borracha de maneira a não permitir a entrada de água.
mas faz ai uma pesquisa que acredito que encontras o tópico do membro que tinha o mesmo problema que tu. Pode ser que existam outras soluções.