Olá Pedro,
Estive com problemas também a nível de sobreaquecimento no meu mk4 1.25. Era a torneira da sofagem. Trabalhava bem, fazia frio e quente, mas ou bloqueava, ou tinha lixo lá dentro, só sei que desde que a troquei o ponteiro anda sempre certinho no meio, e até desce, quando o carro apanha mais frio de frente. Até descobrir o problema o Trevas trocou tudo, alguns tubos, radiador, housing dos tubos do radiador, termostato e o carro sobreaquecia na mesma. O conselho que te dou é anulares a torneira do sofagem por umas 2 semanas. Faz um bypass e logo verás se é daí.
O facto de teres rodado o botão da sofagem para o quente, só faz com que "alivie" a temperatura dá agua que está a circular no motor e a mesma, vai para o radiador da sofagem. Portanto isso é normal, a temperatura descer. Mas é bom fazeres isso antes do motor estoirar,
agora, não é de todo normal, a ventoinha disparar em andamento normal, mais a mais em trajectos curtos. Nunca trocaste o termostato do carro? Não apontava para aí, pois o termostado do meu mk4 era o de origem, já estava meio velhote (normal, 20 anos de idade quase), e trabalhava normalmente, mas pelo preço que custa, cerca de 20€, troca isso.
Espero ter ajudado.